「總統創新獎」的成立，即是鼓勵長期積極投入多元創新與價值創造的產官學研界團體和個人，表彰我國傑出創新成就且對國家經濟發展有具體貢獻者。
得獎名單
第六屆 第五屆 第四屆 第三屆 第二屆 第一屆
第六屆．團體組 元太科技股份有限公司打造電子紙霸業 專利當後盾生態系共好
第六屆．團體組 保瑞藥業股份有限公司臺灣CDMO製藥的領航者 從在地走向全世界
第六屆．團體組 嘖室股份有限公司一年1800件提案 群眾集資催生美好事物
第六屆．一般個人組 國立清華大學 林本堅特聘研究講座教授跳躍六個技術世代 浸潤微影引領全球
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