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海洋委員會國家海洋研究院是中華民國海洋委員會的所屬機構，負責台灣海洋政策規劃、海洋資源調查、海洋科學研究等業務，以及海洋保育與海巡執法人員的教育、訓練、認證及管理。
原行政院版《海洋委員會組織法草案》中並無國家海洋研究院的設置，但民間團體和朝野立委主張應增設海洋保育署與國家海洋研究院。[1][2] 2013年，立法委員邱文彥與田秋堇等提出《海洋委員會組織法草案》版本中增設海洋保育署與國家海洋研究院[3]，最後與行政院版併案完成初審。[4] 2015年5月，立法院朝野黨團協商確認將在海洋委員會裡增設「國家海洋研究院」，6月16日完成組織法草案三讀。[5][6] 2015年7月1日，總統府公布制定《國家海洋研究院組織法》。[7][8] 2018年4月28日，海洋委員會成立，遂組成海洋保育署及國家海洋研究院籌備處，並於12個月內完成協商、整合與移撥事宜。[9] 2019年4月24日，國家海洋研究院於高雄軟體園區揭牌成立。[10] 國家海洋研究院籌備處主任國家海洋研究院院長任別 姓名 任職期間 備註 1 邱永芳 2019年4月24日—2022年6月29日 國立交通大學土木工程研究所工學博士原交通部運輸研究所港灣技術研究中心主任
2 陳建宏 2022年6月30日—迄今 賓夕法尼亞州立大學 航太工程學系哲學博士借調自國立臺灣海洋大學系統工程暨造船學系
院長1人（簡任第十三職等） 副院長2人（簡任第十二職等，必要時其中一人得比照教授資格聘任） 主任秘書1人（簡任第十一職等） 綜合規劃及人力培訓中心 海洋政策及文化研究中心 海洋科學及資訊研究中心 海洋生態及保育研究中心 海洋產業及工程研究中心 秘書室 人事室 主計室海洋委員會海洋保育署【2021臺灣海洋生態環境報告】出版書本詳細資訊－適用對象：成人（業餘消遺）
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